CpG島分析工具用于分析CpG島的潛在區(qū)域，分析算法請(qǐng)參考文獻(xiàn)Gardiner-Garden and Frommer (1987)。算法采用大小為200bp、步長(zhǎng)為1的滑動(dòng)窗口進(jìn)行計(jì)算。CpG島是Obs/Exp值大于60%，GC含量大于50%的一段序列。期望值(Exp)=‘C’的出現(xiàn)次數(shù) * ‘G’的出現(xiàn)次數(shù) / 滑動(dòng)窗口大小。CpG島一般出現(xiàn)在脊椎動(dòng)物基因的5'端，所以此工具可以在基因組中標(biāo)記出潛在基因。